计算机辅助治疗系统有很大潜力，用来提高手术的操作精度并缩短患者恢复时间。在手术中，范围从肿瘤切除和椎间盘突出切除术到颈椎病治疗，该系统可以促进科医生的工作并提高病人的预期。在大多数情况下，手术切口将要小得多，对周围健康组织的损害也达到最小，并能加速患者的恢复周期。
手术从计算机辅助疗法中受益，包括：
- 肿瘤切除
- 切除椎间盘突出
- 脊柱关节融合
- 骨科植入
- 活检
- 脊柱内固定螺钉植入
- 开颅手术
- 深部脑刺激
位置传感器是计算机辅助治疗系统的重要组成部分。目前位置传感器的技术是机械、光学（NDI Polaris和NDI Polaris Accedo），和电磁（NDI Aurora）。NDI Polaris系统是光学系统集成计算机辅助治疗系统的全球领先的供应商。
以下描述了一种典型的计算机辅助疗法，（开颅）手术使用NDI Polaris集成系统。NDI Polaris位置传感器安装在手术室内，在手术进行过程中进行战略定位以便于最大限度提高追踪设备的可见度。患者头部被固定在Mayfield架上（图1）。
NDI Polaris计算机辅助治疗颅内手术应用（图1）进行药物麻醉后，通过与先前已选的置于患者身体基准标记点的物理位置相匹配，患者的身体位置将在术前已获得的MRI数据中“登记”。计算机辅助治疗系统指针简化了这一过程并能确保其准确性。一旦注册完成并由外科医生允许，患者就开始进入手术状态。
NDI Polaris计算机辅助治疗颅内手术应用（图2）当外科医生制定开颅手术的部位和程度方案时，会使用计算机辅助治疗系统。（例如电脑辅助疗法软件界面，参见图3）。颅内侧、外侧、前壁和后缘图像可通过使用指针和正交视图获得。
当皮瓣固定后，使用计算机辅助治疗系统再次确认坐标和MRI数据。外科医生进行开颅手术，解剖硬脑膜并切除肿瘤。由于许多外科医生认为一旦打开颅腔会发生大脑位移，在这部分手术中使用计算机辅助治疗将会受到一定限制。
NDI Polaris计算机辅助治疗颅内手术应用（图3）NDI Polaris集成系统具有很大的灵活性，适用于电脑辅助疗法，是高精确度主被动追踪工具。
